Да, можно сделать заседание закрытым, чтобы третьи лица не узнали коммерческую тайну стороны. 1

Это возможно по ходатайству сторон, участвующих в деле. 1 В соответствии с пунктом 16.2 Постановления Пленума ВАС РФ от 08.10.2012 №61 «Об обеспечении гласности в арбитражном процессе», в случае необходимости сохранения коммерческой, служебной или иной охраняемой законом тайны, разбирательство дела может осуществляться в закрытом судебном заседании по инициативе участвующего в деле лица, заинтересованного в сохранении таких сведений в тайне. 1

Лицо, заявляющее о необходимости проведения закрытого заседания, должно обосновать, в том числе документально, свой тезис о невозможности разглашения тайны, после чего суд, с учётом мнения остальных участвующих в деле лиц, вынесет решение. 2