Да, генеральный директор может зарегистрировать себя как индивидуального предпринимателя и заключить от лица ИП договор со своей компанией на оказание услуг по управлению. 12

Это не противоречит закону, так как индивидуальный предприниматель и общество с ограниченной ответственностью, даже если общество создано и возглавляется ИП как единственным его участником, — это два самостоятельных экономических субъекта, которые вправе заключать сделки между собой. 5

Однако при заключении такого договора важно учитывать, что цель заключения не должна быть способом уменьшения подлежащих к уплате налогов и страховых взносов. 5

Также стоит учитывать, что если сумма сделки перевалит за 60 млн рублей, по ней нужно будет отчитываться отдельно, так как это контролируемая сделка между взаимозависимыми лицами. 1

Для получения более подробной консультации по данному вопросу рекомендуется обратиться к юристу.