Некоторые особенности написания названий государственных учреждений в различных документах:

• В федеральных конституционных законах, федеральных законах, актах, принимаемых палатами Федерального Собрания РФ, указах Президента РФ, постановлениях Правительства РФ рекомендуется употреблять полные наименования федеральных органов исполнительной власти. 1
• В распоряжениях Президента РФ, председателей палат Федерального Собрания РФ, Правительства РФ, стенограммах и протоколах заседаний и совещаний, служебных письмах, а также в документах справочного характера и приложениях к ним рекомендуется использовать сокращённые наименования федеральных органов исполнительной власти. 1
• В наименованиях федеральных органов власти (федеральные министерства, федеральные службы, федеральные агентства) с прописной буквы пишется первое слово. 3 Если в их состав входят имена собственные или названия других учреждений и организаций, то эти имена собственные и названия пишутся так же, как при самостоятельном употреблении. 3
• Названия департаментов, главных управлений, управлений Аппарата Правительства РФ и федеральных органов исполнительной власти пишутся с прописной буквы, названия отделов — со строчной. 1
• В наименованиях академий, научных и высших образовательных учреждений с прописной буквы пишется первое слово, а также имена собственные, входящие в наименование. 1
• В наименованиях средних учебных заведений неединичного характера (техникумы, училища) пишутся со строчной буквы. 1
• Наименования частей и отделов учреждений, организаций, а также слова типа: коллегия, президиум, учёный совет, факультет, отделение, сектор пишутся со строчной буквы. 1