Некоторые недостатки негосударственных экспертных учреждений в России:

• Отсутствие единого перечня экспертных специальностей. 4 Деятельность негосударственных экспертов не подлежит обязательному лицензированию, а их компетентность — сертификации. 4 Перед судебно-следственными органами встаёт проблема определения критериев выбора негосударственных экспертов и оценки качества судебно-экспертного исследования. 4
• Неоднозначность отношения к негосударственным экспертам. 3 Часто заключения таких экспертов отклоняются следователем (судом) из-за несоблюдения процессуальной процедуры производства экспертизы. 3
• Разобщённость в создании и внедрении методик. 4 Ведомства, проводящие судебные экспертизы, создают и внедряют методики исследований без независимой оценки их научной обоснованности. 4
• Перенасыщение рынка негосударственных экспертиз. 1 Многие эксперты работают сразу в нескольких организациях. 1
• Наличие организаций-двойников. 1 Это негосударственные организации, использующие названия, максимально близкие к государственным. 1
• Отсутствие единых правил для государственных и негосударственных экспертных организаций. 2
• Отсутствие единых форм документов для экспертных организаций. 2
• Непрофессиональный уровень некоторых экспертов. 25 В некоторых организациях работают эксперты, которые на практике не занимались экспертизой и не имеют необходимых профессиональных навыков. 2