Некоторые полномочия начальников отделов прокуратуры:

• руководство деятельностью подчинённых прокуратур на основе законов и нормативных актов Генерального прокурора Российской Федерации; 4
• издание приказов, указаний и распоряжений, обязательных для исполнения всеми подчинёнными работниками; 4
• внесение изменений в штатные расписания своих аппаратов и подчинённых прокуратур в пределах численности и фонда оплаты труда, установленных Генеральным прокурором Российской Федерации. 4

Кроме того, начальники отделов, как и другие работники прокуратуры, обладают полномочиями по назначению на должность и освобождению от неё, которые определены статьёй 40.5 Федерального закона от 17.01.1992 №2202-1 «О прокуратуре Российской Федерации». 1