Некоторые виды надзора, которые осуществляет транспортная прокуратура:

• Контроль за исполнением законов в сфере деятельности железнодорожного, воздушного, водного транспорта и в таможенной сфере. 24
• Надзор за соблюдением прав и свобод человека в указанных сферах. 24
• Контроль за исполнением законодательства о противодействии коррупции в органах и учреждениях, действующих на транспорте и в таможенной сфере. 2
• Надзор за исполнением законов при приёме, регистрации и разрешении сообщений о преступлениях на объектах транспорта. 2
• Контроль за исполнением законов о транспортной и авиационной безопасности, безопасности движения и эксплуатации транспорта. 5
• Надзор за соблюдением прав пассажиров, в том числе при формировании тарифов на перевозки. 3
• Контроль за трудовыми отношениями в транспортном секторе, в том числе за соблюдением прав работников, включая пенсионные выплаты. 1
• Координация деятельности правоохранительных органов по борьбе с преступностью на транспорте и в таможенной сфере. 25
• Анализ и обобщение данных о состоянии законности и правопорядка на транспорте и в таможенной сфере, участие в формировании государственной и межведомственной статистической отчётности о работе органов прокуратуры. 2

Полный перечень полномочий транспортной прокуратуры определён приказом Генерального прокурора Российской Федерации от 07.05.2008 №84 «О разграничении компетенции прокуроров территориальных, военных и других специализированных прокуратур». 24