Некоторые специализированные подразделения, которые входят в структуру Следственного комитета России:

• Следственные управления на транспорте. 34 Они занимаются рассмотрением сообщений о преступлениях и предварительным расследованием по уголовным делам о преступлениях на транспорте и в таможенной сфере. 3
• Волжское межрегиональное природоохранное следственное управление. 3
• Следственный отдел (на правах управления) на комплексе «Байконур». 34
• Следственный отдел (на правах управления) в ЗАТО «Межгорье». 3
• Военные следственные органы и входящие в их структуру следственные подразделения. 34

Также в структуру Следственного комитета входят криминалистические подразделения (главное управление, управления и отделы по федеральным округам, управления и отделы по субъектам Российской Федерации). 12