Для проведения независимой антикоррупционной экспертизы используются следующие методы:

1. Анализ каждой структурной единицы (нормы) анализируемого нормативного правового акта или проекта нормативного правового акта на предмет наличия в её тексте коррупциогенных факторов и соблюдения антикоррупционных требований во взаимосвязи с иными нормами этого акта и другими нормативными правовыми актами. 1
2. Сопоставление каждого выявленного коррупциогенного фактора со всеми нормами нормативного правового акта на предмет присутствия коррупциогенных факторов. 1
3. Увязка коррупциогенного фактора с основанными на нём коррупционными проявлениями. 1 Независимому эксперту рекомендуется оценить, какие коррупционные практики могут возникнуть вследствие выявленного коррупциогенного фактора. 1

Также при необходимости субъекты, проводящие антикоррупционную экспертизу, могут привлекать специалистов, которые по результатам готовят предложения, которые могут быть включены в итоговое заключение. 3