Структура Следственного комитета Российской Федерации описана в статье 12 Федерального закона от 28.12.2010 №403-ФЗ «О Следственном комитете Российской Федерации». 2

Система построена по территориальному принципу. 1 Для следственных управлений и главных следственных управлений — с привязкой к границам субъектов РФ, для городских, районных и межрайонных следственных отделов — с привязкой к границам муниципальных образований. 1

Некоторые элементы структуры:

1. Центральный аппарат. 12 Подчинён председателю Следственного комитета и его заместителям. 1 Включает в себя Главное следственное управление, Главное управление криминалистики, управление процессуального контроля и другие. 1
2. Следственные управления и главные следственные управления по субъектам РФ. 1 В их составе есть следственные подразделения по расследованию особо важных дел, отделы процессуального контроля, приёма граждан и документационного обеспечения, криминалистики, финансово-экономического и материально-технического обеспечения. 1
3. Территориальные следственные отделы. 1 Это базовый, низовой уровень системы. 1 Представлен следственными отделами по городам и районам, межрайонными следственными отделами, муниципальными и межмуниципальными следственными отделами. 1
4. Криминалистические подразделения. 12 Включают в себя главное управление, управления и отделы по федеральным округам и субъектам РФ. 12

Также в систему Следственного комитета могут входить судебно-экспертное учреждение, научные и образовательные организации и другие организации, необходимые для обеспечения его деятельности. 12