Руководитель следственного органа может влиять на ход расследования преступлений, используя следующие полномочия: 14

• Поручать производство предварительного следствия следователю либо нескольким следователям, а также изымать уголовное дело у следователя и передавать его другому следователю. 1
• Проверять материалы проверки сообщения о преступлении или материалы уголовного дела, отменять незаконные или необоснованные постановления следователя. 1
• Давать следователю указания о направлении расследования, производстве отдельных следственных действий, привлечении лица в качестве обвиняемого, об избрании в отношении подозреваемого, обвиняемого меры пресечения, о квалификации преступления и об объёме обвинения. 14
• Давать согласие следователю на возбуждение перед судом ходатайства об избрании, о продлении, об отмене или изменении меры пресечения либо о производстве иного процессуального действия, которое допускается на основании судебного решения. 14
• Разрешать отводы, заявленные следователю, а также его самоотводы. 1
• Отстранять следователя от дальнейшего производства расследования, если им допущено нарушение требований УПК РФ. 1
• Продлевать срок предварительного расследования. 14
• Утверждать постановление следователя о прекращении производства по уголовному делу, а также об осуществлении государственной защиты. 14
• Возвращать уголовное дело следователю со своими указаниями о производстве дополнительного расследования. 14

Указания руководителя следственного органа по уголовному делу даются в письменном виде и обязательны для исполнения следователем. 14