Взаимодействие между федеральными и региональными судебными органами происходит через надзорную функцию федеральных судов. 1 Верховный Суд РФ и Высший Арбитражный Суд РФ осуществляют её, обеспечивая единство судебной практики путём кассационного и надзорного производства, а также путём разъяснения вопросов применения действующего законодательства. 1

Кроме того, решения нижестоящих судов подлежат обжалованию в вышестоящий суд. 3

Также деятельность судов субъектов РФ регулируется ещё и законами того субъекта РФ, где они действуют, в то время как федеральные суды действуют на основании только федерального законодательства. 3

Кроме того, федеральные судьи назначаются на должность федеральными органами государственной власти, а судьи субъектов РФ — законодательным (представительным) органом субъекта РФ или избираются народом. 3