Система государственной регистрации судов в России функционирует следующим образом: 14

1. Государственная регистрация осуществляется администрациями бассейнов внутренних водных путей. 14 Она проводится в Государственном судовом реестре и в реестре арендованных иностранных судов. 14
2. Регистрация осуществляется по выбору правообладателя в одной из администраций бассейнов внутренних водных путей Российской Федерации. 14 Судно должно быть зарегистрировано только в одном из реестров. 1
3. При поступлении документов орган государственной регистрации проводит проверку. 1 Он устанавливает соответствие перечня документов перечню, формы документов и их содержания требованиям законодательства РФ, достоверность информации и другое. 1
4. По результатам проверки орган государственной регистрации составляет заключение. 1 Оно является основанием для принятия решения о государственной регистрации или об отказе в ней. 1
5. Государственная регистрация осуществляется в течение 10 рабочих дней со дня поступления заявления и прилагаемых к нему документов на государственную регистрацию права собственности. 12 При подаче электронного заявления этот срок сокращается до 6 рабочих дней. 2

Право плавания под Государственным флагом Российской Федерации возникает с момента государственной регистрации судна в реестрах судов. 14