Федеральные службы и агентства в структуре исполнительной власти различаются по своим функциям: 16

• Федеральные службы осуществляют функции по контролю и надзору в установленной сфере деятельности, а также специальные функции в области обороны, государственной безопасности, защиты и охраны государственной границы Российской Федерации, борьбы с преступностью, общественной безопасности. 16
• Федеральные агентства осуществляют в установленной сфере деятельности функции по оказанию государственных услуг, по управлению государственным имуществом и правоприменительные функции, за исключением функций по контролю и надзору. 16

Таким образом, основное различие заключается в том, что федеральные службы занимаются контрольно-надзорной деятельностью, а федеральные агентства — оказанием государственных услуг и управлением государственным имуществом. 17