Полномочия руководителя следственного органа и начальника отдела отличаются объёмом и характером деятельности. 13
Руководитель следственного органа — полноценная процессуальная фигура, без которой невозможно представить проведение предварительного следствия. 3 Ему передана существенная часть прав, которыми был ранее наделён прокурор в отношении решений, принимаемых следователем при производстве предварительного расследования. 1 Например, руководитель следственного органа может отменять незаконные или необоснованные постановления следователя, разрешать отводы, самоотводы, отстранять следователя, продлевать предварительное расследование, утверждать постановление о прекращении производства по делу и так далее. 3
Начальник отдела осуществляет общую организацию работы отдела: руководит отделом, распределяет уголовные дела и материалы о преступлениях между следователями, регулирует рабочую нагрузку каждого следователя, устанавливает территорию обслуживания или специализацию по расследованию конкретных видов преступлений, определяет распорядок работы отдела и контролирует его соблюдение личным составом. 4 Также он обладает административными полномочиями в отношении административно подчинённых ему следователей: ходатайствует о поощрении следователей либо привлечении их к дисциплинарной ответственности, осуществляет аттестацию следователей и так далее. 4