Основные отличия государственных судебно-экспертных учреждений от частных:

1. Государственные судебно-экспертные учреждения — это специализированные учреждения федеральных органов исполнительной власти, созданные для обеспечения полномочий судов, судей, дознавателей, следователей и прокуроров посредством организации и производства судебной экспертизы. 1 К ним относятся, например, учреждения Минюста, Минздрава, МВД, ФСБ, ФТС, МЧС, Министерства обороны, СК. 2
2. Частные судебно-экспертные учреждения — это некоммерческие организации, созданные в соответствии с законодательством Российской Федерации, к основным видам деятельности которых относится судебно-экспертная деятельность. 3 К ним относятся НИИ, вузы, аудиторские и оценочные организации. 2

Кроме того, для негосударственных организаций законодательство не предусматривает требований к экспертам, в то время как в государственных учреждениях к ним предъявляют определённые требования: высшее образование, специализированное, дополнительные повышения квалификации раз в 5 лет. 2