Основные отличия должностей гражданской службы в федеральных органах власти от региональных:

1. Учреждение. 25 Должности федеральной гражданской службы учреждаются федеральным законом или указом Президента Российской Федерации. 25 Должности гражданской службы субъектов РФ — законами или иными нормативными правовыми актами субъектов РФ. 25
2. Оплата труда. 1 Профессиональная деятельность федеральных гражданских служащих оплачивается за счёт средств федерального бюджета, а региональных — из бюджета соответствующих регионов. 1
3. Реестр должностей. 3 Реестр должностей федеральной государственной гражданской службы утверждается указом Президента Российской Федерации, а региональной — законом или иным нормативным правовым актом субъекта РФ. 35

При этом и федеральные, и региональные должности гражданской службы имеют общую структуру, разделённую на категории и группы. 12