Возможно, имелись в виду различия между понятиями «акты федеральных министерств и агентств» и «приказы ведомств».

Акты федеральных органов исполнительной власти — это нормативные правовые акты, которые издают министерства, федеральные службы, агентства и другие федеральные органы власти. 5 К таким актам относятся, например, постановления, правила, инструкции и положения. 4

Приказ — распорядительный документ, который издают от имени федерального органа исполнительной власти и который регламентирует наиболее важные вопросы деятельности этого органа. 1

Таким образом, возможно, имелись в виду различия в характере издаваемых документов: акты федеральных органов исполнительной власти — это более общее понятие, а приказ — конкретный вид такого акта.