Чем отличается следственная комиссия от контрольной комиссии?

Возможно, имелись в виду различия между функциями следственной и контрольной комиссий.

Следственная комиссия занимается, например, расследованием преступлений, обеспечением законности при приёме, регистрации и проверке сообщений о преступлениях, возбуждением уголовных дел и т. д.. sudact.ru base.garant.ru

Контрольная комиссия, в свою очередь, может контролировать, например, соблюдение членами саморегулируемой организации федеральных законов, стандартов и правил профессиональной деятельности. sro-au.ru

Таким образом, основное отличие заключается в сферах деятельности: следственная комиссия работает в области уголовного судопроизводства, а контрольная комиссия — в сфере профессионального контроля и соблюдения определённых правил и стандартов.