Деятельность военной комендатуры, в отличие от других правоохранительных органов, имеет некоторые специфические задачи, связанные с обеспечением законности, правопорядка и воинской дисциплины в Вооружённых Силах РФ. 14

Некоторые из таких задач:

• Организация патрульной службы в общественных местах, воинских частях, районах проведения учений и ликвидации последствий аварий и катастроф. 13
• Предупреждение и пресечение преступлений, административных правонарушений и дисциплинарных проступков, совершаемых военнослужащими и лицами гражданского персонала. 13
• Охрана места происшествия и обеспечение сохранности следов преступления или административного правонарушения. 13
• Выявление военнослужащих, имеющих намерение совершить правонарушение, и проведение с ними индивидуальной профилактической работы. 1
• Обеспечение охраны объектов Вооружённых Сил, служебных помещений органов военной прокуратуры и военных следственных органов. 12
• Розыск и задержание военнослужащих, уклоняющихся от военной службы, а также содействие органам внутренних дел в розыске военнослужащих и лиц гражданского персонала, совершивших преступление. 25
• Обеспечение государственной защиты потерпевших, свидетелей и иных участников уголовного судопроизводства из числа военнослужащих. 1

Таким образом, в отличие от других правоохранительных органов, военная комендатура фокусируется на обеспечении безопасности и правопорядка в специфической среде Вооружённых Сил РФ.