Летучие мыши относятся к отряду рукокрылых (лат. Chiroptera) класса млекопитающих. 12

Традиционно рукокрылых делят на два подотряда: крыланы (Megachiroptera) и летучие мыши (Microchiroptera). 15

Крыланы включают, например, летучих собак или лисиц. 1

Летучие мыши включают такие группы, как:

• Надсемейство Emballonuroidea: футлярохвостые. 1
• Надсемейство Rhinopomatoidea: мышехвосты или ланцетоносы, свиноносые. 1
• Надсемейство Rhinolophoidea: подковоносые, щелемордые, копьеносые. 1
• Надсемейство Vespertilionoidea: гладконосые или обыкновенные летучие мыши, или кожановые. 1
• Надсемейство Molossoidea: бульдоговые летучие мыши или складчатогубые. 1
• Надсемейство Nataloidea: клейконогие или воронкоухие, розетконогие, присосконогие, дымчатые летучие мыши. 1
• Надсемейство Noctilionoidea: рыбоядные летучие мыши или зайцегубые, футлярокрылые, подбородколистые, листоносые. 1

По разным данным, выделяют от 600 до 1000 видов летучих мышей. 2