В одном кубическом метре межзвёздного пространства можно обнаружить один атом водорода. Чем же ещё оно заполнено и материально ли оно?

Межзвёздное пространство не является пустым, оно заполнено межзвёздной средой, которая состоит из вещества и полей. ru.wikipedia.org bigenc.ru

Основные компоненты межзвёздной среды:

• Межзвёздный газ. ru.wikipedia.org bigenc.ru Состоит преимущественно из водорода (около 90%) и гелия (около 10%) с небольшими примесями других элементов. dzen.ru
• Межзвёздная пыль. dzen.ru bigenc.ru Представляет собой мельчайшие твёрдые частицы размером от нескольких нанометров до микрометров. dzen.ru
• Межзвёздные электромагнитные поля. ru.wikipedia.org
• Космические лучи. ru.wikipedia.org {6-host}
• Гипотетическая тёмная материя. ru.wikipedia.org {6-host}

Да, межзвёздное пространство материально, так как содержит вещество и поля, которые его заполняют. ru.wikipedia.org {8-host}