Словосочетание «само собой» обособляется запятыми, если выступает в роли вводного сочетания и его можно заменить синонимами «несомненно», «конечно». 3
Пример: «Само собой, я совсем не против участвовать в этом мероприятии». 1
Если «само собой» относится к сказуемому и отвечает на вопрос «как», то оно выступает в роли обстоятельства образа действия и не обособляется. 1 Пример: «Удивительно, но настроение само собой улучшилось, и я смогла, наконец, взять себя в руки». 1