Популяционная генетика применяется в следующих сферах:

• Управление природными популяциями. 1 Популяционная генетика служит теоретической основой управления, мониторинга и сохранения природных популяций. 1
• Морской промысел. 1 Данные популяционной генетики используют при проведении границ экономических территорий морского промысла. 1
• Разработка методов борьбы с паразитами и вредителями. 1
• Установление степени родства этносов. 1
• Восстановление эволюционной истории человечества. 1
• Селекция растений и животных. 34 Биометрическая теория популяционной генетики, оперирующая наборами фенотипов изучаемых объектов, используется в селекции растений и животных. 34