СКС-грамматики применяются в различных областях науки, включая:

• Обработку естественных языков. 12 В частности, некоторые системы распознавания речи используют СКС-грамматики для улучшения качества распознавания. 1
• Изучение молекул РНК. 12 СКС-грамматики используются для моделирования последовательностей в семействах РНК-генов и поиска последовательностей генома для вероятных членов этих семейств. 12

Также СКС-грамматики применяются для поиска РНК-генов с помощью сравнительной геномики, исследуя гомологи потенциальных РНК-генов двух родственных организмов и определяя, сохраняется ли вторичная структура. 12

Таким образом, область применения СКС-грамматик охватывает разные научные сферы, от лингвистики до биологии.