Процесс аннигиляции применяется в научных исследованиях, в частности в физике элементарных частиц. 23

Некоторые области, где используется аннигиляция:

• Получение монохроматического пучка фотонов с высокой энергией. 2 Для этого физики-экспериментаторы используют прохождение быстрых позитронов через вещество, в результате чего образуется пучок высокоэнергетических гамма-квантов. 2
• Расчёт удельной теплоёмкости металлов при очень низких температурах. 2 Для этого используют распределение возникающих при аннигиляции фотонов по их углам разлёта. 2
• Образование бозона Хиггса. 3 Этот процесс происходит при столкновениях двух нуклонов при очень высоких энергиях. 3

В настоящее время применение аннигиляции в энергетических или военных целях невозможно, так как не удаётся создать и удержать на достаточно долгое время нужное количество антивещества. 45