Инфузории-туфельки используются в различных областях науки и образования, например:

• В научных исследованиях. 1 Инфузория служит модельным организмом для изучения влияния различных химических веществ на количество и поведение инфузорий, что помогает лучше понять их экологическую роль. 1 Также в лабораториях инфузорий используют для обнаружения в воде тех или иных примесей. 2
• В биотестировании. 14 С помощью инфузорий определяют качество напитков, а также оценивают токсичность кормов, лекарств, полимерных материалов и питьевой воды. 4
• В образовательных учреждениях. 1 Инфузории помогают ученикам наглядно знакомиться с жизненным циклом и поведением микроорганизмов. 1 Для этого в образовательных учреждениях используют электронные пособия с микросъёмками экспериментов. 1