Различия между массовым и методическим отбором заключаются в целях и принципах отбора.

Массовый отбор направлен на сохранение постоянства породных или сортовых качеств. 1 При таком отборе отбирают группы особей по внешним (фенотипическим) признакам без проверки их генотипа. 2 В результате массового отбора формируется группа особей, которые обладают нужными и полезными для человека признаками. 7

Методический отбор проводится с целью выведения нового сорта или породы, обладающих определёнными признаками. 1 Селекционер отбирает из исходного материала особей, в которых намечаются интересующие его признаки. 1 Для отобранных экземпляров создаются соответствующие условия жизни и особый уход. 1 Затем, начиная уже с первого потомства, из поколения в поколение ведётся строгий отбор лучшего материала и выбраковка всего того, что не удовлетворяет предъявляемым требованиям. 1

Таким образом, массовый отбор фокусируется на сохранении существующих качеств, а методический — на создании новых с определёнными характеристиками.