В чем заключаются различия между историческим и современным корнем слова?

Некоторые различия между историческим и современным корнем слова заключаются в том, что в процессе исторического развития языка изменялся способ образования основ и морфологический состав слова. studlandia.com

Некоторые примеры таких изменений:

• Чередование звуков. zigzag-24.ru В чередующихся корнях происходит закономерная смена звуков в зависимости от условий словообразования или исторических изменений. zigzag-24.ru Например, в парах «собирать — собрать», «зарастать — вырастить». zigzag-24.ru
• Утрата суффиксов. zigzag-24.ru Например, в слове «водить» суффикс «-вод-» утрачен, и образуется пара «водить» — «ведение» с корнем «-вод-/-вед-». zigzag-24.ru
• Потеря связи с основой. studlandia.com В современном языке есть случаи, когда слово теряет связь с основой, от которой оно образовано, или начинает соотноситься не с производящей основой в целом, а лишь с частью её. studlandia.com

При этом для многих слов в современном языке морфемы выделяются так же, как и в прошлом. studlandia.com

Таким образом, различия заключаются в том, что в результате исторического развития языка некоторые корни меняют форму, а в отдельных случаях меняется их структура.