Основные различия между факторами инициации у прокариот и эукариот:

• Количество факторов. 1 У прокариот инициация трансляции обеспечивается тремя белковыми факторами (IF-1, IF-2, IF-3). 4 У эукариот в процессе участвуют, по крайней мере, 13 общих эукариотических факторов инициации (eIF), представленных 31 полипептидом. 1
• Механизм выбора стартового сайта. 3 У прокариот сайты инициации в полицистронных мРНК выбираются путём спаривания оснований с рибосомальной РНК. 3 У эукариот сайты инициации достигаются с помощью механизма сканирования: рибосомы присоединяются к мРНК в области кэпа и сканируют её в поисках стартового кодона. 12