Преимущества водородных связей для стабилизации белковых структур заключаются в следующем:

• Позволяют белковой структуре конформироваться таким образом, чтобы форма белковой молекулы становилась спиральной. 12
• Делают структуры типа α-спирали или β-складчатого слоя достаточно прочными. 3 Хотя водородные связи слабее ковалентных, присутствие их в значительном количестве обеспечивает стабильность белковой молекулы. 3
• Сохраняют нативную структуру белка, позволяют осуществлять простейшие функции и защищают от разрушения. 5
• Снижают гидрофильность и увеличивают гидрофобность белковой молекулы. 5

Таким образом, хотя водородные связи — слабые связи, их большое количество обеспечивает стабильность белковой молекулы. 4