Некоторые преимущества тандемной масс-спектрометрии перед другими методами анализа:

• Высокая чувствительность и возможность идентификации малых количеств веществ. 1 Для получения достоверного масс-спектра индивидуального соединения достаточно 10–9–10–10 г вещества. 4
• Точность идентификации. 1 Метод позволяет проводить дополнительные стадии фрагментации молекул, что даёт более детальную информацию о структуре анализируемых веществ. 1
• Возможность работы с малым объёмом образцов. 1 В некоторых случаях разделение может происходить в самом масс-спектрометре, минуя стадию ВЭЖХ, что упрощает конфигурацию оборудования. 2
• Разрешение сложных смесей. 12 Тандемная масс-спектрометрия даёт возможность фокусироваться на исходных ионах с выбранным отношением массы к заряду и регулировать условия фрагментации для получения уникального масс-спектра вещества. 2