Преимущества метода исследования в проходящем свете заключаются в следующем:

• Возможность обнаруживать сверхмелкие детали. 3 Размеры таких деталей (порядка 2 нм) значительно меньше пределов разрешения наиболее сильных микроскопов. 3
• Получение изображений прозрачных неабсорбирующих объектов. 1 Они невидимы при освещении по методу светлого поля. 1
• Количественная оценка изменений в цвете образца. 4 Это полезно, например, для документирования и измерения изменений в пигментах, которые многие растительные клетки содержат в видимом уровне. 4
• Обеспечение клеточного и организменного контекста для флуоресцентных оптических срезов, генерируемых конфокально. 4 Детектор проходящего света позволяет получать изображения, которые имеют пространственную и временную регистрацию с изображениями флуоресценции. 4