Преимущества метода циклического лигазного секвенирования при анализе ДНК заключаются в следующем:

• Высокая точность секвенирования. 1 Каждый нуклеодит прочитывается дважды, что способствует коррекции ошибок. 1
• Определение нуклеотидной последовательности фрагментов ДНК размером 25–75 п. о.. 2
• Возможность фиксировать широкий спектр мутаций. 2 Метод помогает анализировать даже небольшие замены, инсерции и делеции, инверсии и транслокации. 2
• Отсутствие необходимости этапа клонирования фрагментов ДНК. 2 Это значительно экономит время исследования. 2
• Возможность параллельного проведения миллиардов реакций даже в малых объёмах, что даёт доступ к более обширным данным на выходе. 2