Преимущества компьютерного анализа геномов по сравнению с традиционными методами исследования заключаются в следующем:

• Ускорение процесса. 1 Экспериментальный поиск одного гена занимает недели и месяцы работы целой лаборатории, а компьютерные методы позволяют сделать это за считанные минуты. 1
• Возможность обрабатывать огромный массив данных. 2 Биоинформатические методы позволяют не просто обрабатывать данные, но и выявлять закономерности, которые не всегда можно заметить при обычном эксперименте. 2
• Предсказание функций генов и зашифрованных в них белков. 2 Также можно строить модели взаимодействия генов в клетке. 2
• Выявление сходных участков геномов разных организмов. 1 Это даёт возможность находить гены при сравнении геномов отдаленно родственных видов, например, для установления происхождения видов и более крупных таксонов. 1