Некоторые преимущества клеточной селекции растений перед традиционными методами:

• Возможность проводить селекционные и генетические манипуляции с миллионами генотипов в малом объёме. 3 Это позволяет экономить ресурсы и средства, избегать негативного влияния факторов среды. 3
• Ускорение создания нового сорта. 35 Проведение селекции на клеточном уровне позволяет создавать новые формы растений в 2–4 раза быстрее по сравнению с традиционными способами селекции. 5
• Получение растений с хозяйственно важными признаками. 3 Например, устойчивых к гербицидам, стрессовым факторам, некоторым заболеваниям. 3
• Возможность идентифицировать линии растений с повышенной биологической продуктивностью. 2 Продуктивность культивируемых клеток в результате клеточной селекции может значительно превышать продуктивность целых растений. 2
• Размножение растений, трудно размножаемых традиционными способами. 1
• Возможность проведения работ в течение всего года. 1
• Возможность автоматизации процесса выращивания. 1

Клеточная селекция не заменяет селекционный процесс, а служит его дополнением для повышения эффективности и ускорения результативности. 3