Преимущества использования плазмидных векторов для генной инженерии:

• Относительно простые карты рестрикции. 13 Это увеличивает вероятность наличия в плазмидах единичных сайтов узнавания для конкретных рестриктаз и облегчает составление подобных карт у клонируемых фрагментов. 13
• Устойчивость молекул ДНК к повреждениям при манипулировании ими in vitro. 13
• Мультикопийность. 13 Плазмидные векторы, как правило, способны умножать (амплифицировать) число клонируемых генов в сотни и тысячи раз. 1
• Большая вероятность обнаружения рекомбинантной ДНК с помощью различных зондов в процедуре скрининга методом гибридизации. 3 С повышением размера плазмид уменьшается их копийность, что ослабляет сигнал детекции. 3

По этим причинам плазмидные векторы используют для клонирования небольших фрагментов ДНК (размер рекомбинантной ДНК обычно не превышает 10–15 т.п.н.). 3