Преимущества электрофоретического метода детекции результатов ПЦР:

• позволяет анализировать продукты амплификации с помощью различных методов электрофореза в агарозном или полиакриламидном гелях; 2
• для визуализации ДНК используют окрашивание интеркалирующим красителем, серебра нитратом или мечение различными флюорохромами. 2

Некоторые недостатки электрофоретической детекции:

• большие затраты времени на стадию детекции; 1
• невозможность автоматизации; 1
• сложность и субъективность трактовки результатов; 1
• высокий риск контаминации и большие затраты на её устранение. 1