Преимущества использования молекулярных методов для классификации растений:

• Надёжность, информативность, достоверность и воспроизводимость результатов. 1 Молекулярные маркеры отличаются от морфологических и биохимических методов исследования. 1
• Устойчивость результатов к внешним факторам. 1
• Возможность проводить предварительный отбор на ранних стадиях. 2 С помощью молекулярных маркеров можно быстро определить наличие искомого признака, например, устойчивости к болезням или вымоканию. 2

Недостатки использования молекулярных методов:

• Необходимость большого количества и ДНК высокого качества, что может увеличивать затраты на анализ. 4
• Сложности с анализом сложных полигенных признаков растений, так как арсенал методов для этого не очень богат и разнообразен. 3