Некоторые преимущества гибридизации соматических клеток при создании гибридов:

• Возможность скрещивания отдалённых видов растений, которые невозможно скрестить обычным половым путём. 14
• Получение асимметричных гибридов, несущих весь генный набор одного из родителей наряду с несколькими хромосомами другого. 14
• Создание системы гибридизации, включающей одновременное слияние трёх и более родительских клеток. 14
• Получение генетически модифицированных гибридных растений, так как протопласт является идеальным реципиентом для чужеродной ДНК. 1
• Создание сортов сельскохозяйственных культур с желаемыми признаками, такими как устойчивость к болезням, стрессоустойчивость и повышенная урожайность. 2
• Создание новых сортов растений с уникальными сочетаниями признаков, не встречающихся в традиционных программах селекции. 2
• Участие в биотехнологических исследованиях, например, в изучении экспрессии генов, функциональной геномики и понимании механизмов развития растений и стрессовых реакций. 2