Преимущества аффинной хроматографии перед другими методами выделения белков:

• Высокая селективность и разрешающая способность. 2 Молекулы разделяются на основе специфических функциональных свойств, а не физико-химических. 1
• Быстрое разделение веществ. 1 Процессы носят динамический характер. 1
• Возможность разделения веществ в большом объёме. 1 Из-за избирательности сорбции есть возможность использовать большие объёмы исходных препаратов и в ходе ступенчатой элюции осуществлять их эффективное концентрирование. 5
• Обратимый процесс связывания. 1 Целевое вещество можно удалить в активной форме. 4
• Небольшой расход лигандов. 1

Кроме того, специалисты часто совмещают метод аффинной хроматографии с другими, что расширяет возможности хроматографии. 1