Отличия между методами окраски гематоксилином и эозином и другими методами гистологического исследования заключаются в следующих особенностях:

• Окраска гематоксилином и эозином — один из самых распространённых методов в гистологии. 4 Он позволяет выявить почти все клеточные и неклеточные структуры. 2 Ядра становятся сине-фиолетовыми, а цитоплазма — желтовато-розовой. 2
• Некоторые структуры плохо прокрашиваются гематоксилином и эозином (как правило, гидрофобные) и требуют иных методов окраски. 4 Например, участки клеток, богатые липидами и миелином, остаются неокрашенными: адипоциты, миелиновая оболочка аксонов нейронов, мембрана аппарата Гольджи и др.. 4

Другие методы гистологического исследования включают:

• Окраску гематоксилин-пикрофуксином по методу Ван Гизона. 6 Этот метод по-разному окрашивает различные ткани: соединительная ткань после окраски пикрофуксином имеет ярко-красный цвет, а все остальные ткани — буровато-жёлтый или жёлто-зелёный. 6
• Импрегнацию. 7 Метод выявления тканевых структур путём пропитывания объектов гистологического исследования растворами солей тяжёлых и драгоценных металлов. 7 Участки ткани, в которых происходит восстановление солей металлов и осаждение их на гистологических структурах, приобретают чёрный или бурый цвет в зависимости от количества и свойств восстановленного металла. 7
• Гисто- и иммуноцитохимические методы. 57 В их основе лежит применение химических реакций для выявления распределения химических веществ в структурах клеток, тканей и органов. 5 Современные гистохимические методы позволяют обнаруживать аминокислоты, белки, нуклеиновые кислоты, различные виды углеводов, липидов и др.. 5