Основные отличия между функцией run() и классом Popen в модуле subprocess:

1. Функция run() запускает указанную программу и ждёт окончания её работы. 1 Она возвращает объект CompletedProcess, содержащий результаты работы. 3
2. Класс Popen сразу после запуска указанного процесса возвращает управление, то есть запущенный процесс будет выполняться в фоновом режиме по отношению к родительскому процессу. 1 Класс позволяет взаимодействовать со стандартными потоками ввода, вывода и ошибок. 2

Таким образом, функцию run() следует использовать, если нужно просто запустить команду и захватить её вывод, а класс Popen — если требуется больший контроль над процессом, например, взаимодействие с его потоками ввода и вывода. 2