Некоторые отличия между бактериальными фотосинтезирующими пигментами и хлорофиллом растений:

• Состав пигментов: у растений это хлорофиллы, а у бактерий — бактериохлорофиллы. 25 Бактериохлорофиллы сходны с хлорофиллами по структуре, но способны поглощать красный свет большей длины волны и даже инфракрасное излучение. 2
• Локализация: у растений пигменты содержатся в пластидах (хлоропластах), а у бактерий — в светочувствительных органах (хроматофорах). 47
• Процесс образования водорода: у бактерий водород образуется в результате распада сероводорода (изредка — карбоновых кислот), а у растений — в результате распада воды. 47