Особенности протокооперации в биоценозе заключаются в совместном существовании, выгодном для обоих видов, но не являющемся обязательным условием выживания. 1

Такие организмы способны жить отдельно друг от друга, хотя совместное проживание существенно повышает уровень жизни. 3

Некоторые примеры протокооперации:

• Опыление пчёлами луговых растений. 1 Пчёлы могут брать нектар у разных видов растений, а цветки клевера могут опыляться не только пчёлами, но и шмелями, мухами и другими насекомыми. 4
• Взаимоотношения рака-отшельника и актинии. 3 У рака-отшельника мягкий панцирь: без помощи актинии, которая выступает защитником его тела, раку довольно сложно выжить. 3 Актиния же не может двигаться — это существенно ограничивает её в пространстве добывания пропитания. 3 За счёт протокооперации у неё появляется больше пространства для охоты и возможность довольно активно передвигаться по территории. 3
• Взаимодействие между почвенными бактериями или грибами и растениями, которые произрастают в почве. 5 Ни один из видов не полагается на эти взаимоотношения для выживания, но все грибы, бактерии и высшие растения принимают участие в формировании состава почвы и её плодородия. 5