Особенности использования красителей разных типов при микробиологических исследованиях заключаются в их способности окрашивать определённые структуры микроорганизмов:

• Основные красители содержат красящий катион и бесцветный анион. 1 Они обладают большим сродством к структурам микробной клетки, так как красящая часть основных красителей несёт положительный заряд. 1 Основные красители более интенсивно связываются с ядерными (кислыми) компонентами клеток. 2
• Кислые красители состоят из красящего аниона и бесцветного катиона. 1 Они способны окрашивать клетку лишь при низких значениях pH. 1 При обычных значениях pH кислые красители слабо фиксируются клеткой и легко удаляются из неё при отмывании. 1 Поэтому кислые красители используются при так называемой негативной окраске, когда окрашивается фон препарата, на котором видны неокрашенные бактерии. 1
• Нейтральные красители представляют собой смесь кислых и основных красителей. 1 Такой краситель способен окрашивать клеточные элементы, характеризующиеся как ацидофилией, так и базофилией. 1 Примером нейтрального красителя является краска Гимзы, применяемая для окраски спирохет и простейших. 1