В чем заключаются основные различия между бактериями различных доменов?

Возможно, имелись в виду различия между бактериями, археями и эукариотами, которые составляют три домена в трёхдоменной системе биологической классификации. ru.wikipedia.org foxford.ru

Некоторые различия между этими группами:

• Строение клеток. biocpm.ru У бактерий и архей нет мембранных органоидов и ядра, их ДНК находится непосредственно в цитоплазме. foxford.ru У эукариот есть оформленное ядро, отделённое от цитоплазмы ядерной оболочкой. foxford.ru
• Рибосомы. biocpm.ru Рибосомы бактерий состоят из трёх молекул рРНК, в то время как рибосомы архей по некоторым признакам похожи на бактериальные, а по некоторым — на эукариотические. biocpm.ru
• Строение жгутиков. biocpm.ru Бактериальные жгутики образованы белком флагеллином, который, закручиваясь в спираль, формирует полую внутри нить жгутика. biocpm.ru Жгутики архей похожи на бактериальные, но не имеют полости внутри и образованы гликопротеинами. biocpm.ru
• Метаболизм. foxford.ru Прокариотическим организмам — археям и бактериям — свойственно большое разнообразие метаболизма: разные типы автотрофности (фотосинтез и хемосинтез), гетеротрофность и миксотрофность. foxford.ru
• Эволюционная история. ru.wikipedia.org Археи обладают уникальной древней эволюционной историей, поэтому их считают одними из древнейших организмов на Земле. ru.wikipedia.org

Представители каждого из трёх доменов имеют свои особенности, благодаря которым они занимают определённые экологические ниши и выполняют конкретные функции. ru.wikipedia.org