Некоторые различия между методами выделения ДНК в растительном и животном материале:

• Клеточная стенка. 14 В отличие от клеток животных, растительные клетки окружены прочной целлюлозной клеточной стенкой. 4 Это затрудняет выделение ДНК, так как необходимо разрушить стенку и нарушить целостность клеток. 4
• Наличие загрязняющих веществ. 3 Растительные ткани содержат полисахариды, полифенолы, белки и липиды, которые действуют как загрязняющие вещества во время выделения ДНК. 3 Их количество варьируется в зависимости от вида растения, используемой части растения, условий окружающей среды и стадии роста. 3
• Выбор объекта для выделения. 1 Исследователи предпочитают выделять ДНК из молодых растений, так как они содержат меньше вторичных метаболитов. 15
• Возможность высвобождения части ДНК простым нагреванием. 2 Из клеток животных часть ДНК можно высвободить простым нагреванием, а с растениями так не получится, так как они защищены прочной клеточной стенкой из целлюлозы. 2

При этом для всех источников нуклеиновых кислот общими остаются три этапа выделения: лизис, очистка ДНК от других компонентов клеточного лизата и элюирование — отделение ДНК от других веществ и последующее её концентрирование. 5