Основные различия в способах гаструляции у разных групп позвоночных заключаются в следующем:

• У ланцетника гаструляция осуществляется путём инвагинации — впячивания стенки бластулы. 25
• У амфибий и рыб гаструляция происходит путём эпиболии — обрастания крупных бластомеров более мелкими делящимися бластомерами. 2
• У рыб, птиц и млекопитающих гаструляция совершается путём деламинации — расщепления бластодермы на два слоя. 2
• У высших позвоночных (птиц и млекопитающих) в процессе гаструляции бластопор не образуется. 12

Также у разных групп позвоночных есть различия в последовательности процессов гаструляции: например, у амфибий все три зародышевых листка образуются одновременно, а у птиц гаструляция распадается на последовательно протекающие процессы. 3