Некоторые различия между ботаникой и микологией:

• Предмет изучения: ботаника занимается растениями, а микология — грибами. 24
• Задачи: ботаника изучает, например, морфологию, систематику, биологию, физиологию растений, а микология — морфологию, систематику, экологию, географию, филогению грибов, а также их роль в природе и жизни человека. 2
• Сфера применения: ботаника связана с изучением растений, в то время как микология имеет связи с фитопатологией, медициной, ветеринарией, промышленностью. 2

При этом микология долгое время была частью ботаники, поскольку грибы относили к царству растений. 14 Поэтому в современной микологии сохранились научные традиции, характерные для ботаники. 4