Основные различия между классической систематикой и филогенетической классификацией:

1. Цель:

• Классическая систематика стремится к разработке единой классификации (таксономической системы), посредством которой выражается всеобщий закон или принцип упорядочения таксономического разнообразия. 6
• Филогенетическая классификация занимается выявлением и прояснением эволюционных взаимоотношений среди разных видов жизни на Земле, как современных, так и вымерших. 58

1. Подход:

• Классическая систематика стремится охарактеризовать таксоны путём указания на их сущностные признаки, неизменные во времени и позволяющие надёжно отграничить один таксон от другого. 9
• Филогенетическая классификация использует все доступные признаки для интерпретации филогении (эволюции) таксона. 7

1. Уровень рассмотрения исторического развития биоты:

• Классическая систематика уделяет основное внимание макроэволюционным процессам. 1
• Филогенетическая классификация фокусируется на вопросах, относящихся к микроэволюционному уровню (виды, подвиды). 1